EVML kõrgeimaks juhtimisorganiks on liikmete üldkoosolek, mis kutsutakse kokku 2 korda aastas.
EVML juhatus valitakse üldkoosoleku poolt 3 aastaks. Juhatus on 11 liikmeline : EVML president, bowlingusektsiooni president, sportkeeglisektsiooni president, bowlingusektsiooni juhatusse valitakse 5 liiget ja sportkeeglisektsiooni juhatusse valitakse 3 liiget.